Постоянная экспозиция музея посвящена истории района и его памятных мест, судьбам ближайших сподвижников Петра I: Франца Лефорта, Якова Брюса, Николаса Бидлоо, Александра Меншикова и других. В музее представлены репродукции портретов Петра I и некоторых из его сподвижников, а также собрана уникальная коллекция подлинного исторического оружия: западноевропейский карабин с колесцовым замком конца XVI века; 6-фунтовая пушка времен Северной войны, ручная граната начала XVIII века; арабское фитильное ружье, ятаган (ориентировочно конец XVIII века), русское армейское кремневое ружье 1814 года, пистолеты с ударно-кремневым и капсульным замками и многое другое.

Особо ценные экспонаты — печать рода Брюсов и подлинное женское платье со складкой Ватто 1752 года. В экспозиции имеются также предметы быта начала XVIII века: шкатулка, подсвечник, солонка, курительные трубки, фрагмент паркета из дома голландского лекаря Захарии Ван дер Гульста. Представлены в экспозиции и образцы военной формы Петровской эпохи, форма учащихся военно-учебных заведений XIX века. Также в музее выставлена копия облачения сестры милосердия общины «Утоли моя печали». Сейчас в бывшем здании общины на Госпитальной площади располагается Городская клиническая больница №29. Особое внимание уделяется показу предметов быта XIX – начала ХХ века. Среди них — складной дорожный подсвечник, складной столовый прибор, ножницы для снятия верхушки яйца, письменный прибор и другие. Многие из экспонатов были найдены при строительстве жилых кварталов и станций метро.

Аудиогид